地震や津波、火災など、園児を災害から守るために年間を通して（月に１回）避難訓練を実施しています。
　地震や津波に関しましては、藤沢市の地震対策（関東大震災級マグニチュード７．９、鵠沼地区最大津波３ｍと想定）をベースにして、地震・津波対策を進めております。藤沢市の津波ハザードマップでは、湘南学園は浸水域に入っておりませんが、想定の３倍の津波でも、幼小中高とも３階以上（海抜１０ｍ）に避難すれば安全と考えております。各校とも、災害時は保護者の方に引き渡しするまで、お子さんを確実にお預かりしています。

　保育中に熱が出たり、気分が悪くなったときは、養護教諭の指示を仰ぎ、処置をし、ただちに保護者に連絡をします。医師の処置が必要な場合は保護者に連絡をし、保育者または養護教諭が付き添い、病院に連れて行きます。